陈继盛召集南海水师诸将，分析讨论海盗意图，最终，俞咨皋坐镇广东，陈继盛亲率万名精锐水师坐镇厦门。

所部高应岳，张永产，刘应宠，邓枢各率领五千精锐水师，在南海水师辖区巡游，密切监视李魁奇部海盗。

两军狭路相逢，迅速将海盗逼向厦门港。

李魁奇事先不知陈继盛率领重兵坐镇厦门，率军发起偷袭时，遭遇陈继盛领兵展开凶猛还击。

海岸陈列的火炮齐射，成排成排火铳射击，当场击沉李魁奇部三十多艘大型战船，二十多艘小型战船。

李魁奇尚未回过神，陈继盛率领水军杀出，夜间，海面化为火海，陈继盛更冲上李魁奇战船，斩杀李魁奇部两名头领。

李魁奇丢盔弃甲，率领少量残部落荒而逃。

明军在厦门大获全胜，重创李魁奇部，然而，李魁奇的后援部队在泉州得逞，成功劫掠沿海村庄，击沉朝廷十几艘船只，封锁泉州港，迫使泉州附近的村庄向他们进贡粮食，猪牛，更肆意劫掠百姓。

为此，福建巡抚熊文灿大怒，要求泉州卫兵出击，迅速击溃李魁奇的海盗，解救百姓，恢复泉州港的秩序。

可惜卫兵战力羸弱，远不及彪悍的海盗，非但没能击溃海盗，反而损兵折将。

直到陈继盛率领南海水师杀来，派遣南路副总高应岳为先锋，率领水师纠缠李魁奇部，他亲自领兵从外面包围李魁奇部，欲将李魁奇部绞杀在泉州港附近。

此时，各路海盗暧昧，有人试图劝和，有人开始和熊文灿，王尊德接触，计划率兵投降。

李魁奇被困在泉州港，数次率兵突围，均遭陈继盛率军击溃，不久，郑芝龙率领东海水师抵达，精兵两万，战舰四五百、火炮上千门，全军装备掣电铳，鲁密铳。

这支精兵乃郑芝龙班底，经过朝廷配备和补充各类火器，铠甲，经过一年多训练，战力更胜从前。孟乔芳率领四卫军抵达福建，迅速接管福建边防。

顷刻，李魁奇处境越发艰难，陈继盛率领万名精兵追杀，已经够让他难堪，结果老对手郑芝龙率领两万精兵杀来。