安南名义上再入大明版图。

后黎朝旧臣阮淦、郑检原是关系密切的战友与同盟。阮淦十分赏识郑检的才能，还将女儿许配给郑检。

阮淦遭人暗杀后，郑检控制了后黎朝的实权。

阮淦的两个儿子阮汪、阮潢颇有才能，为郑检所忌惮。

阮汪官居左相，经常受到郑检的排斥打压，最后更被杀。阮淦的另一儿子阮潢惶惶不可终日，便自请出镇顺化、广南，以消除郑检的戒心。

当时的顺化、广南一带刚刚经历战火，形势不明朗，许多当地人甚至越海投奔莫朝，因而被郑检视为“鸡肋”。

阮潢由此取得了安南最南方广南地区的统治权。

阮潢在广南地区积极经营，争取人心，巩固统治，使广南成为后黎朝南部稳定的大后方，并不断吸纳从越南北方逃避瘟疫及战祸的平民，逐渐发展成“阮主”政权。

1613年，阮潢逝世后，阮潢的第六子阮福源继位，自称“仁国公”。

1615年左右，阮福源允许葡萄牙人建立商业港口费福（今会安）。开始从葡萄牙人手中购买欧洲的先进大炮，同时学习欧洲船舶的设计方法，在葡萄牙的协助下阮氏开始了自己西洋铜炮的生产。

许多中国人、日本人、欧洲人和东南亚人来到费福港进行贸易。海外贸易为物力短缺的南阮提供了维持政权的物质支持，使南阮不仅能够抗衡北郑，甚至能腾出余力向南拓展新领土。

从阮潢入镇顺广开始，南阮也秉承后黎朝的国策，不断向南蚕食占城和真腊的土地。

郑检去世后，郑检次子郑松继位。

1592年，郑松攻破莫朝，后黎朝重返升龙（河内）。

此时郑松权势炙手可热，人称“郑主”，黎皇只负责临朝听政及接见使节。后世史家以“黎氏为皇，郑氏执政”来形容此一局面。

郑松以后黎朝的名义遣使赴大明，请求大明恢复“安南国王”的册封，万历皇帝未予以同意，仅授予“安南都统使”头衔。

郑松虽然攻破莫朝，但莫朝势力并未被完全消灭。