随着建州女真的崛起，再加上草原上的蒙古，大明的北方边境会变得不宁。

朱翊钧到不是担心他们闹出什么乱子，可是万历皇帝知道，如果真的按照历史发展，建州女真会成为心腹之患。他们会把大明的精力牵扯到边境，每年大量的消耗粮草，让本就疲惫的大明，更加的疲于奔命。

万历二年秋，山西应州朔州山阴马邑大同等县及安东中屯山阴阴和高山等卫各以灾报。

南直隶高邮州以东两淮所辖吕四等场大旱之后，又发生狂风暴雨，河海并溢，庐舍倾圮万余区，溺死居民一千六百余人，家畜无数，仓库盐场漂荡无存，百姓流离失所，饥馑无食。徐州扬州等大雨为灾，海啸河溢。

这件事情之后，朱翊钧知道地球不安分了，小冰川期来了。

从这个时候开始，大明便动荡不安了起来，各种各样的天灾会进一步吞噬大明的寿命。百姓流离失所，如果没有什么作为，农民起义的大火迟早都会星星燎原。

万历三年，这一年地球倒是太平了，可是朝廷又不太平了。

彻底掌握了朝廷的张居正开始了大规模的清洗，官员致士的致士，罢官的罢官，张居正开始大规模的提拔自己的人。整个大明朝的官场改天换地，正是步入张居正时代。

东南亚的战争进行的如火如荼，林凤与西班牙人的战斗越发的激烈了起来。

势单力孤的林凤在菲律宾兵败以后，引兵内犯，曾到达柘林，靖海，碣石等地。同时也到达过福建等处，依台湾魍港为基地四处劫掠。但是当时福建方面打击海盗很严厉，林凤四处碰壁，只得离去。

胡守仁再次击败林凤，林凤引兵退至广东进犯潮州。当时潮州的参政金浙主抚，林凤本人也看见了闽广两省的水师力量很大，意冷心灰不作进一步的抵抗准备。

于是林凤的手下马志善，李成等一千七百一十二人被招降，六百六十八名男女百姓被收容。林凤素知中国传统以来对待所谓盗贼毫不留情，只身逃往外洋，下落不明。