科学忍军的十人战斗班组，制式武器为木叶63式螺旋丸突击步枪，该步枪有两种射击模式，既可以连续发射微型风遁螺旋手里剑，也可以短暂充能后发射大威力螺旋丸榴弹。

制式装甲为查克拉铠甲3型，这种盔甲外观和剧场版雪之国忍着装备的查克拉铠甲相似，除了具有很强的物理防御力和忍术防御力之外，背后安装有折叠飞翼，支持穿戴者短距离内低空滑翔以增加机动性。

小队的狙击手装备木叶64式雷磁遁狙击步枪，这种步枪口径12.7，特种狙击弹头由查克拉金属制造，灌注查克拉之后穿透力惊人，发射方式乃是在雷磁遁导轨上进行电磁加速，出膛速度极高，有效射程三千米，最大射程六千米。

狙击手一般由日向家白眼忍者担任，狙击手和观察员组成狙击小组，观察员佩戴着多功能科学忍具头盔，头盔上安装了人造白眼和人造写轮眼，在不执行狙击任务的时候，观察员也兼任小队侦查员。

班组中的火力支援手一般由身高体壮的壮汉担任，装备集束式起爆符发射器和卷轴弹链供弹六管苦无火神炮。

集束式起爆符发射器，顾名思义就是将一百张起爆符打捆卷起，装入火箭助推榴弹中，由发射器将其投射到一公里外的地方阵地上，进行覆盖式轰炸。

卷轴弹链供弹六管火神炮的外形和现实世界中的加特林火神炮相似，不过弹链却是一卷卷轴纸，每一卷卷轴中封印着一千枚苦无，当卷轴转过火神炮枪匣时，封印在其中的苦无就会依次解除通灵状态，在雷磁遁的加速之下飞射出去。

工程兵装备了“土遁木遁”科学忍具护腕，查克拉铠甲也换为5外骨骼工程版，负重能力优秀，背包里装载大量高能效起爆黏土，装备的武器为木叶63式螺旋丸散弹枪。

工程兵的职责是“逢山开道遇水搭桥”，“土遁木遁”科学忍具护腕可以在一分钟内搭建临时便桥，绝不会出现神无昆桥战役中重要桥梁被毁后勤部队就无法输送给养的情况。

科学忍军的士兵都经过了极为严格的体术训练，体术能力普遍较为出众，忍术幻术能力则由装备补足，单兵作战能力相当于中忍，集群作战能力则要远超只有少数上忍带队中忍作为主力战斗人员的旧式忍军。

科学忍军十人班组的指挥员可以通过背负大功率电台的联络员随时与后方指挥中心通话，在战势紧迫的情况下呼叫空中支援，空中支援分为三种，第一种是呼叫轰炸机轰炸指定坐标，第二种是呼叫旋翼运输机前来接走伤员，第三种是呼叫装备风遁滑翔翼的高机动单兵飞行兵作为援军抵达现场。